决明查尔酮合成酶的同源模建和分子模拟对接
【出 处】:《
天然产物研究与开发
》
CAS
CSCD
2013年第25卷第9期 1175-1179页,共5页
【作 者】:
李云双
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周虹
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钟德馨
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方袁梦梦
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王万军
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廖海
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周嘉裕
【摘 要】
查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)是植物中类黄酮生物合成途径的关键酶,其催化对-香豆酰辅酶A和丙二酸单酰辅酶A发生缩合反应。本研究以苜蓿CHS的晶体为模板,利用同源建模构建决明CHS的三维模型。经过动力学优化后,决明CHS的三维模型与苜蓿CHS的结构极为相似,主要由甜螺旋和β-折叠构成,其中有13个α螺旋,占32.82%,15个β折叠,占19.23%,无规则卷曲占47.95%。模型验证结果表明决明CHS的三维模型具有合理的立体化学性质与氨基酸相容性。决明CHS含有两个重要的结构域:对.香豆酰辅酶A结合域与丙二酸单酰辅酶A结合域。决明CHS与对.香豆酰辅酶A、丙二酸单酰辅酶A的结合主要通过氢键与范德华力。决明CHS中Cysl64、His303与活性中心的H2O能够形成电子传递体系,参与对-香豆酰辅酶A形成CHS-对-香豆酰基中间产物。本研究结果为利用此类CHS三维模型研究其催化机理和分子工程改造奠定基础。
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